Muvakkithane, Selimiye Camii’nin şerif kuyusu caddesi’ne bakan avlu duvarı üzerinde doğudadır. Muvakkithane, kuzeydoğu uçta eğrisel kenarlı dikdörtgen planlı tonoz örtülü bir yapıdır. Tek hücreli yapının girişi Selimiye Camii avlusunda kuzeydoğudadır.