İznik Yenişehir Kapısı yakınında bulunan kilise kalıntısının Hagios Tryphon kilisesi olduğu sanılmaktadır. Bu kilisenin İstanbul Kapısı yakınındaki kalıntı ile isim olarak karıştığı ve kesin bir sonuç da alınamadığı bilinmektedir.
VIII. Mikhael Palaiologos ile patrik Arsenios İznik’i terk ederken buradaki Agalma Manastırında bir gece geçirmiştir. Kilisenin de Agalma Manastırına ait olduğunu Prof. Dr. Semavi Eyice ileri sürmektedir.
Kilise 1946 yılında yapılan çalışmalar sırasında ortaya çıkarılmıştır. Kapalı Yunan haçı planında bir yapı olup, günümüze yalnızca temel kalıntıları ile çevreye dağılmış mimari parçaları gelebilmiştir. Kilisenin üst yapısına ait önemli bir kalıntı bulunamamıştır. Bununla beraber yapılan araştırmalar bu yapının İstanbul’daki Khora (Kariye)’ya benzeyen mimari bir yapısı olduğu ve içerisinin döşeme mozaikleri ile süslendiğini ortaya koymuştur.