Amasya ili 1. derecede tehlikeli deprem bölgesinde olup Kuzey Anadolu Fay Sistemi’nin etki sahası içindedir. Tarihsel dönemde de yıkıcı depremlerin meydana geldiği Amasya ili 1916 M= 7.1 Tokat,1939 M=7.9 Erzincan,1942 M=7.0 Niksar –Erbaa ve 1943 M= 7.2 Tosya-Ladikdepremlerinde ağır hasar görmüştür. 1996 yılında da bölgede büyüklüğü 5.5 ve 5.6 olan 2 adet hasar yapıcı deprem meydana gelmiştir.
İl merkezi ve Taşova ilçesinde yoğun olmakla birlikte Gümüşhacıköy ilçesinde de heyelan olayları gözlenmektedir. Kaya düşmesi olayı Merkez ilçe ve bağlı yerleşim birimlerinde gözlenmektedir. Özellikle il merkezinde Harşena dağının (Kral mezarlarının olduğu bölge) şehre bakan yüzeyinde bulunan konutların tamamı kaya düşmesi riskine maruz bulunmaktadır.
Su baskını olayları, Yeşilırmak ve Kızılırmak havzalarında yer alan ilimizin Merkez, Taşova ve Merzifon ilçelerinde yoğun olarak gözlenmektedir.